Head of engineering en Fullcircle
Web: pinchito.es
BlueSky: pinchito.bsky.social
Mastodon: mastodon.social/@pinchito
No me limpié los dientes durante tres días y después tomé una muestra del material que se había alojado en pequeñas cantidades en las encías sobre mis incisivos… Encontré algunos animálculos vivos.
In the fields of observation
fortune favours only the prepared mind.
Las primas ignoradas
Alrededor de una micra (µm)
Las más pequeñas: 100 nm
Las más grandes (Thiomargarita namibiensis): 0.75 mm
14% de la biomasa
¿% de la biomasa?
Infecciones no sintomáticas
+ tracto urinario superior
Bacterias con función desconocida
Staphylococcus epidermidis,
capaz de segregar antibióticos
Colonias bacterianas en
cerebros sanos
Sólo el comienzo
Pseudomonas syringae:
formación de nieve, cañones
Arthrobacter sulfonivorans: formación de estala(ct|gm)itas
Extremófilos que se alimentan de:
Un ecosistema hasta
el fin de los tiempos
Las bacterias revividas (Bacillus marismortui) son
las criaturas más longevas conocidas
6 bits por palabra
64 valores → 20 aminoácidos
Corrección de errores
Plegamiento de proteínas en 3D
Pseudo-genes, material no codificante
Virus ~
ZX Spectrum
Bacteria ~
Psion Organiser
Human ~
CD-ROM
ADN → ROM (sólo lectura)
ARN → RAM (lectura + escritura)
Memoria epigenética → RAM (lectura + escritura)
¿Memoria externa?
¿Almacenamiento en la nube?
Intercambio de información:
Se toma del medio cuando es necesario
Se libera cuando no hace falta
Great Fountain en el Parque de Yellowstone
Bacterias viviendo a más de 70 ºC
Thermus aquaticus: extremófilo (hipertermófilo)
Polimerasa: amplifica una secuencia de un gen
Procesamiento a alta temperatura
En 1976 se usó la polimerasa de Thermus aquaticus
Pirococcus furiosus: crecimiento óptimo a 100 ºC
Kary Mullis: premio Nobel de química, 1993.
Regulación magnética
Almacenamiento de información
Procesadores biológicos
Seguimiento de Escherichia coli
Una generación cada 75 días
Mutación para aprovechar el sustrato
Semmelweiss (1847): lavado de manos
entre necropsia y parto:
reducción de muertes del 22% al 3%
Ingresado en un manicomio vienés a traición,
murió a los 14 días de gangrena
¿Venganza bacteriana?
Eliminación del 99.9%:
Recuperación tras 10 horas
Eliminación del 99.99%:
Recuperación tras 13:20 horas
Cada "9" gana 3 horas 20 minutos
60% de enfermedades humanas
Animales domésticos
Fauna salvaje
Murciélagos: Ébola, coronavirus
Producen anticuerpos
Mutación rápida
Activación ante infecciones
De la médula ósea al bazo
Segregan citoquinas
Generadas aleatoriamente en la médula osea
En el timo (esternón) pasan pruebas de integración
El 95% fracasan y son destruídas
Circulan entre el sistema linfático y la sangre
Piden "los papeles" a las células que se encuentran
Destruyen a las que producen proteínas sospechosas
The unprepared mind cannot see
the outstretched hand of opportunity.
Premio Nobel de Medicina 1945
Cepa de Penicillium chrysogenum usada todavía hoy
Encontrada en un melón del mercado
Antibióticos sin receta en farmacia rural de Vietnam
Salinas de Santa Pola en Alicante
Arquea halofílica Haloferax mediterranei
Extrañas secuencias genéticas repetidas
Las llamó CRISPR
Edición de genes CRISPR/Cas9
Premio Nobel de Química 2020
Diabetes tipo I
Esclerosis múltiple
Enfermedad de Crohn
Enfermedad de Hashimoto
Esclerosis lateral amiotrófica
Espondilitis anquilosante
Artritis reumatoide
Colitis ulcerosa
Vitíligo
Lupus
...
Identificada por Burrill Crohn en 1932
Afecta normalmente al colon y al íleo
Inflamación intestinal
Diarreas y pérdida de peso
Muy grave si no se trata
Los casos se duplican cada década
¿Industrialización y urbanización?
¿Hipótesis de la higiene?
Disparador desconocido
Causas desconocidas
Factores: estrés, tabaco, dieta
Factores genéticos:
defectos en macrófagos (CARD15)
Medicamentos inmunomoduladores
(antes "inmunosupresores")
A veces contienen la enfermedad
Minimizan los síntomas
Pacientes crónicos pero sin brotes
Ganado doméstico: vacas, cabras, ovejas
Rumiantes salvajes: ciervo, liebre, muflón
Causa: Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis
(MAP para sus enemigos)
Síntomas: diarrea, pérdida de peso
Heces
Vías de agua
Sobrevive a la cloración
Leche materna
¿Sobrevive a la pasteurización?
La enfermedad de Johne en el ganado tiene muchos parecidos con la ileitis humana en su configuración anatómica.
Conocida desde la antigüedad
Epidemia en los 70 y 80
10% de la población
1% de las hospitalizaciones
Causas atribuidas:
Colabora con Robin Warren
Sospechan de un agente infeccioso
Aíslan Helicobacter pylori
Les rechazan varias publicaciones
Desarrolla úlcera
Se cura con bismuto + metronidazol
Empieza a curar pacientes
Thomas Borody (1989): añade tetraciclina
Premio Nobel de medicina (2005) para Marshall y Warren
Crimen: enfermedad de Crohn
Sospechosa: MAP
Móvil: transmisión zoonótica
Modus operandi: bacterias camufladas
Coartada: ¿no hay MAP en tejidos?
Terapia antibiótica anti-MAP
Desarrollada por Thomas Borody y equipo
Ensayo clínico exitoso
Graham, D.Y. et al.:
Randomized, Double-Blind, Placebo-Controlled Study of Anti-Mycobacterial Therapy (RHB-104) in Active Crohn’s Disease.
Antibiotics 2024, 13, 694.
Fase I: medicamento seguro en pacientes sanos
Fase II: eficacia en pacientes enfermos
Fase III: cientos o miles de pacientes
Doble ciego: randomizados en grupos
Más de $20M y muchos años
Resultado: 1 bit de información
Sanderson, Jeremy et al.:
"A phase 1b clinical trial to determine the safety, tolerability and immunogenicity of simian adenovirus and poxvirus vectored vaccines against a Mycobacterium avium complex subspecies in patients with active Crohn's disease"
The Lancet (eBioMedicine), Volume 113, 105570
Diabetes tipo I
Esclerosis múltiple: MAP
Enfermedad de Hashimoto
Sarcoidosis: otras micobacterias
Lupus eritematoso: biofilms bacterianos
ELA: enterovirus
Una gran proporción de enfermedades “autoinmunes” están causadas en realidad por infecciones bacterianas o víricas, que confunden al sistema inmune.
¿Es curar pacientes un modelo de negocio sostenible?
(En una rara muestra de candidez corporativa)
Curar enfermedades no es negocio
Tratarlas sí
¿Quién paga el pato?
Isabel Reche, 2018:
Cubos de recogida estériles en Sierra Nevada
(a 3 km de altura)
Decenas de millones de bacterias
Billones de virus por metro cuadrado y día
Estratosfera, 40 km de altura:
sigue habiendo bacterias
Mesosfera, 77 km de altura:
sigue habiendo bacterias
Termosfera, 100+ km de altura:
ADN de bacterias en la ISS
Esterilización de carne picada
Dosis masivas de radiación: 10 kGy
(5 Gy fríen a un humano)
La carne se seguía estropeando
Aislaron Deinococcus radiodurans
Homo sapiens (perzona umana): 5 Gy.
Rattus rattus (rata negra): 7.5 Gy.
Blatella germanica (cucaracha): 64 Gy.
Amoeba proteus (ameba): 1000 Gy.
Milnesium tardigradum (temible oso de agua): 5 kGy.
E. coli: 2.5 kGy.
Truepera radiovictrix: 5 kGy.
Deinococcus radiodurans: 10 kGy.
Rubrobacter radiotolerans: 11 kGy.
Thermococcus gammatolerans: 30 kGy.
Thermococcus gammatolerans sobreviviría 15 segundos en el muro interior del reactor de fusión más poderoso del mundo...
...o un día en el vaso de contención de Fukushima
tras la fusión del núcleo de 2011.
¿Procedencia extraterrestre?
¿O simple resistencia a la desecación?
Oxígeno, agua líquida, metano, compuestos orgánicos complejos.
4 de 5 pruebas positivas en la Viking Lander (1976)
Anaxágoras de Clazómene (s. IV a.C.):
[...] semillas recorriendo el cosmos [...]
Arrhenius (1908):
Pero un pequeño número de esporas caerá en otro mundo, y pueden ser capaces de dispersar la vida allí si las condiciones fueran favorables.
Stephen Hawking (2009):
La vida podría extenderse de planeta en planeta o incluso de sistema estelar en sistema estelar, llevada por meteoritos.
Carl Sagan (1980):
El nitrógeno en nuestro ADN, el calcio de nuestros dientes, el hierro en nuestra sangre, el carbono en nuestras tartas se forjaron en el interior de estrellas colapsándose. Estamos hechos de estrellas.
200 estrellas
Misma edad y composición que nuestro Sol
(4 mil millones de años)
A 3000 años luz de distancia
Mismo periodo de rotación que el Sol (26 días)
¿Tenemos primos en este pueblo?
Análisis del código genético
Calidad regulera
Optimizado para producción
Convivimos con billones de bacterias
Las bacterias no son nuestras enemigas
No sobreviviríamos ni un día sin ellas
No es una guerra, es una collab...
... que a veces sale mal
Las bacterias se adaptan al medio
Pueden tardan días o incluso horas
La evolución no tiene un objetivo
Antibióticos en exceso ➜ resistencia
Se acabaron las enfermedades “fáciles”
Relaciones oblicuas entre patógenos y síntomas
Bacterias difíciles de localizar
Necesitamos volver a la investigación básica
Investiga por tu cuenta
Aprende sobre tus dolencias
Entiende por qué se aplican los tratamientos
Busca buena atención médica
Aprende a distinguir buenos y malos médicos
Cristina Pacios, bióloga molecular
Azahara Fernández, doctora en inmunología
María Gómez Romero: bioinformática
Carlos J Santisteban: profesor de tecnología
Mario Montes: organizador T3chFest