CAIS 2019 | Congreso Argentino de Salud

¿CÓMO UTILIZAMOS SNOMED-CT?

SnomedCT del registro a la estrategia

Lic. Botta Mariano Andrés

Título de la presentación

RESEÑA HISTORIA

Evolución de las herramientas aportadas por SNOMED-CT

SNOMED DATABASE LOADER

Scripts para importar RF2 a distintas bases SQL.

Mappeo CSV a tablas SQL.
No tiene endpoints estandar.
Poco expresividad.
Las consultas a la DB no estaban definidas.
Baja performance.

(*) https://github.com/IHTSDO/snomed-database-loader

MongoDB + Node.Js

Set de herramientas para importar RF2 a MongoDB y conjuntos de APIs en NodeJS

Endpoints.
APIs documentadas.
Importador de RF2 a MongoDB.
Soporte para ECL.
Optimizaciones en el diseño de las colecciones.

FEATURES:

(*) https://github.com/IHTSDO/sct-snapshot-rest-api

(*) https://github.com/IHTSDO/rf2-to-json-conversion

MongoDB + Node.Js

Set de herramientas para importar RF2 a MongoDB y conjuntos de APIs en NodeJS

No se pueden aplicar DELTA.
No soporta campos adicionales para RefSets.
Importador poco eficiente.
ECL no completo.

Desventajas/Faltantes:

Título de la presentación

SNOWSTORM

Elasticsearch + Java Spring

SNOWSTORM

Elasticsearch + Java Spring

Endpoints bien definidos.
APIs documentadas (SWAGGER).
Escala horizontalmente.
Versionado de la herramienta.
Docker y Kubernetes.

FEATURES GENERALES:

(*) https://github.com/IHTSDO/snowstorn

SNOWSTORM

Elasticsearch + Java Spring

Importador de RF2 incorporado.
Versionado de ediciones.
Snapshot - Full - Delta.
ECL Completo.
Datos adicionales de reference set (ICD-10, MRCM).
Autoría de conceptos.

FEATURES ESPECÍFICAS:

(*) https://github.com/IHTSDO/snowstorn

SNOWSTORM

Elasticsearch + Java Spring

FHIR API.
Soporte de búsqueda en multi-lenguajes
Machine Readeable Concept Model

FEATURES ESPECÍFICAS:

(*) https://github.com/IHTSDO/snowstorn

Título de la presentación

VERSIONADO DE EDICIONES

SNOWSTORM

Versionado de ediciones - Orientado a Servidor de Terminología.

(*) https://github.com/IHTSDO/snowstorm/blob/master/docs/loading-snomed.md

Edición como base principal.
Crear rama
Aplicar una extensión.
Actualizaciones mediante deltas:

De Base y de extensión.

Título de la presentación

ENDPOINTS MÁS FRECUENTES

Descripción básica de un concepto

GET /{branch}/concepts/{conceptId}

brach
conceptId

Parámetros:

Respuesta:

{
  "active": true,
  "conceptId": "string",
  "definitionStatus": "string",
  "effectiveTime": "string",
  "fsn": "string",
  "id": "string",
  "isLeafInferred": true,
  "isLeafStated": true,
  "moduleId": "string",
  "pt": "string"
}

Descripción amplia de un concepto

GET /browser/{branch}/concepts/{conceptId}

brach
conceptID

Parámetros:

Respuesta:

{
  "active": true, 
  "conceptId": "string",
  "definitionStatusId": "string",
  "descriptions": [
    {
      "acceptabilityMap": {},
      "lang": "string", 
      "term": "string",  
    }
  ],
  "fsn": "string",
  "relationships": [
    {
      
      "characteristicType": "string",
       "target": {
        "active": true,
        "conceptId": "string",
        "definitionStatus": "string",
        "fsn": "string", 
      },
      "type": {
        "active": true,
        "conceptId": "string",
        "definitionStatus": "string", 
        "fsn": "string", 
      }
    }
  ]
}