Procesamiento, segmentación y registro en imágenes médicas
BE3027 - Robótica Médica
¿Qué tenemos pendiente?
Import and Spatial Referencing
Display, Volume Rendering, and Surfaces
Preprocessing and Augmentation
GroundTruth Labeling and Segmentation
Adquisición y reconstrucción
Análisis y/o aplicación
ya tenemos esto
Preprocessing and Augmentation
GroundTruth Labeling and Segmentation
Análisis y/o aplicación
falta hablar un poco de esto
Import and Spatial Referencing
Display, Volume Rendering, and Surfaces
Adquisición y reconstrucción
Procesamiento, aumento y segmentación
pueden lograrse mediante técnicas "clásicas" de procesamiento de imágenes (thresholding, filtrado, histogramas, etc.) o empleando machine learning
Procesamiento, aumento y segmentación
pueden lograrse mediante técnicas "clásicas" de procesamiento de imágenes (thresholding, filtrado, histogramas, etc.) o empleando machine learning
Procesamiento, aumento y segmentación
pueden lograrse mediante técnicas "clásicas" de procesamiento de imágenes (thresholding, filtrado, histogramas, etc.) o empleando machine learning
último módulo del curso
Un último detalle
Registro
Registro
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Registro
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¿Cómo? puntos característicos como landmarks o fiducials
Registro
\{A\}
x_A
y_A
x_B
y_B
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\{A\}
\{B\}
Registro
\{A\}
\{B\}
x_A
y_A
x_B
y_B
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Registro
\{A\}
\{B\}
x_A
y_A
x_B
y_B
{^A}\mathbf{T}_B
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sabemos que
debe existir
Registro
Registro
en el caso más simple:
- misma cantidad de puntos
- la transformación | distorsión puede representarse con una transformación rígida
Registro
- distinto número de puntos
- rotación + traslación + shear + escalamiento = transformación afín
un caso más complicado (pero aún lineal):
Registro
- distinto número de puntos
- rotación + traslación + shear + escalamiento = transformación afín
un caso más complicado (pero aún lineal):
uno de los algoritmos más empleados para efectuar este tipo de registro es el Iterative Closest Point (ICP)
>> be3027_clase13_ejemplo_registro.mlx
Registro
también existen casos aún más complicados
Registro
también existen casos aún más complicados
hay diversos algoritmos para resolver el problema, incluso unos que emplean intensidades o contornos en lugar de puntos, o bien combinaciones entre estos
Registro
también existen casos aún más complicados
sin embargo, no nos interesarán mucho los detalles de implementación ya que emplearemos herramientas de software especializadas
Registro
también existen casos aún más complicados
sin embargo, no nos interesarán mucho los detalles de implementación ya que emplearemos herramientas de software especializadas
Agenda ejemplo 3D Slicer
- Cargando archivos DICOM y NIfTI.
- Interfaz y visualización en 2D y 3D.
- Coordenadas intrínsecas y anatómicas.
- Markups.
- Segmentación y procesamiento.
- Transformaciones y registro.
>> be3027_clase13_lungctscan.zip
>> be3027_clase13_brainspinemri.nii.gz
BE3027 - Lecture 13 (2024)
By Miguel Enrique Zea Arenales
