Desarrollo de Tableros Web de Visualización de Datos con Python, Dash y Dash Sylvereye
Dr. Alberto García Robledo
CentroGeo Querétaro
Escuela de Verano Científico CentroGeo 2022
Contenido
- ¿Qué es Dash?
- Layouts y callbacks de Dash
- Actividad: Visualizando correlaciones
- Dash Sylvereye: Visualización de redes de caminos
- Actividad: Visualizando las calles más largas
¿Qué es Dash?
¿Qué es Dash?
-
Dash es código abierto, publicado bajo la licencia MIT.
-
Está disponible para múltiples lenguajes:
-
Python
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R
-
Julia
-
.NET
-
Instalación
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En una terminal, instala Dash a través de pip:
pip install dash-
Si prefieres desarrollar en Jupyter Notebook o Jupyter Lab, instala jupyter-dash:
pip install jupyter-dash
-
En este taller utilizaremos Google Colab
Layouts de Dash
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Una aplicación Dash está integrada de dos partes:
-
La descripción del UI (layout)
-
La descripción de la interactividad (callbacks)
-
-
Un layout de Dash está integrado de uno o más componentes Dash anidados. Los hay de dos tipos:
Ejemplo 1: Hello Dash
Ejemplo 1: Hello Dash
import dash_html_components as html
from jupyter_dash import JupyterDash
app = JupyterDash(__name__)
app.layout = html.Div([
html.H1('H1 header!'),
html.H2('H2 header!'),
html.H3('H3 header!'),
html.H4('H4 header!'),
html.H5('H5 header!'),
html.H6('H6 header!'),
])
app.run_server()Ejemplo 1: Para recordar
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dash_html_components provee un componente Dash por cada etiqueta HTML.
-
Un layout está compuesto por Dash components anidados:
-
Un layout de Dash es parecido a un árbol DOM.
-
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El componente raíz de un layout es asignado a app.layout.
Ejemplo 2: Markdown
Ejemplo 2: Markdown
from jupyter_dash import JupyterDash
import dash_core_components as dcc
import dash_html_components as html
app = JupyterDash(__name__)
markdown = '''
# Lorem Ipsum
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'''
app.layout = html.Div([
dcc.Markdown(children=markdown)
])
app.run_server()Ejemplo 2: Para recordar
-
Puede ser tedioso construir un layout utilizando únicamente los dash_html_components.
-
Para desplegar bloques de texto con formato de manera rápida, puedes usar el componente Markdown del dash_core_components.
Ejemplo 3: Hello Graph
Ejemplo 3: Hello Graph
Ejemplo 3: Hello Graph
from jupyter_dash import JupyterDash
import dash_core_components as dcc
import dash_html_components as html
import plotly.express as px
df = px.data.iris() # iris is a pandas DataFrame
app = JupyterDash(__name__)
fig = px.scatter(df, x='petal_length', y='sepal_length')
app.layout = html.Div([
dcc.Graph(
figure=fig,
style={'height': 300},
)
])
app.run_server()Ejemplo 3: Para recordar
-
Puedes utilizar DataFrames de Pandas como la fuente de datos de tus tableros Dash.
-
Dash provee Plotly Express, el cual contiene funciones para crear gráficas ricas y complejas de manera fácil.
-
El componente dcc.Graph puede visualizar figuras generadas por Plotly y Plotly Express:
- Sólo hay que pasar la figura Plotly al componente dcc.Graph a través del argumento "figure"
Callbacks de Dash
-
Un callback es una función de Python que permite definir la interacción de un tablero Dash.
-
Cada componente Dash puede tener un id único
-
Un callback contiene uno o más Input y Output:
-
Cada entrada/salida está asociada al id de un componente y a un atributo del componente.
-
Ejemplo 4: Callback simple
Ejemplo 4: Callback simple
import dash_html_components as html
import dash_core_components as dcc
from jupyter_dash import JupyterDash
from dash.dependencies import Input, Output
app = JupyterDash(__name__)
app.layout = html.Div([
html.Div(['Text:',
dcc.Input(id='text-input',
value='',
type='text')]),
html.Div(id='echo-div')
])
@app.callback(
Output('echo-div', 'children'),
Input('text-input', 'value')
)
def update_echo_div_callback(text_value):
if text_value:
return f'Echo: {text_value}'
app.run_server()Ejemplo 4: Para recordar
-
Es necesario asignar un id único a un componente si deseamos hacer referencia a éste en un callback.
-
Un Output dado sólo puede aparecer en un callback.
-
Pero un Input dado puede aparecer en más de un callback.
-
Los callbacks son disparados de manera automática al iniciar la aplicación.
Ejemplo 5: Múltiples Inputs y Outputs
xy+c\text{\,\,\,for\,\,\,}y=1...5
Ejemplo 5: Múltiples Inputs y Outputs
from jupyter_dash import JupyterDash
import dash_core_components as dcc
import dash_html_components as html
from dash.dependencies import Input, Output
app = JupyterDash(__name__)
app.layout = html.Div([
dcc.Input(
id='x',
type='number',
value=1
),
dcc.Input(
id='c',
type='number',
value=0
),
html.Table([
html.Tr(html.Td(id='y-1-td')),
html.Tr(html.Td(id='y-2-td')),
html.Tr(html.Td(id='y-3-td')),
html.Tr(html.Td(id='y-4-td')),
html.Tr(html.Td(id='y-5-td'))
])
])
@app.callback(
Output('y-1-td', 'children'),
Output('y-2-td', 'children'),
Output('y-3-td', 'children'),
Output('y-4-td', 'children'),
Output('y-5-td', 'children'),
Input('x', 'value'),
Input('c', 'value'))
def compute_callback(x, c):
if (not x is None) and (not c is None):
return x*1+c, x*2+c, x*3+c, x*4+c, x*5+c
app.run_server(debug=True)Ejemplo 5: Para recordar
-
Un callback puede tener múltiples Inputs y Outputs
-
Tienes que asegurarte que todos los Inputs tengan valores válidos:
-
Puedes pasar prevent_initial_call = True al decorador de un callback para evitar que el callback se dispare automáticamente
-
Diseñar callbacks puede ser complicado en un principio ¡No te desanimes!
-
Componentes Dash de terceros
-
Dash provee herramientas para que puedas desarrollar tus propios componentes
-
Básicamente, un componente Dash no es más que un envoltorio de un componente React.js
-
Dash goza de una nutrida comunidad de desarrolladores que han creado sus propios componentes Dash
Dash Bootstrap Components
-
Provee componentes de UI basados en el framework Bootstrap 4:
-
Modal
-
Cards
-
Form
-
Jumbotron
-
Navbar
-
Actividad 1: Correlaciones
Actividad 1: Correlaciones
Paso 0. Haz una copia del siguiente notebook:
Actividad 1: Correlaciones
Paso 1. Asigna a la variable df el dataset Iris provisto por Plotly Express:
Actividad 1: Correlaciones
df = px.data.iris() # iris is a pandas DataFrameActividad 1: Correlaciones
Paso 2. Define un Dropdown que tenga como options diferentes columnas del dataset. Asígnale el id xaxis-dropdown:
dcc.Dropdown(
id='xaxis-dropdown',
options=[
{'label': 'sepal_width', 'value': 'sepal_width'},
{'label': 'sepal_length', 'value': 'sepal_length'},
{'label': 'petal_length', 'value': 'petal_length'}
],
value='sepal_width',
)
Actividad 1: Correlaciones
Paso 3. Define otro Dropdown que tenga como options diferentes columnas del dataset. Asígnale el id yaxis-dropdown:
dcc.Dropdown(
id='yaxis-dropdown',
options=[
{'label': 'sepal_width', 'value': 'sepal_width'},
{'label': 'sepal_length', 'value': 'sepal_length'},
{'label': 'petal_length', 'value': 'petal_length'}
],
value='sepal_width',
)
Actividad 1: Correlaciones
Paso 4. un objeto dcc.Graph en el layout en donde se ubicará el scatterplot. Asígnale el id top-graph:
dbc.Col(dcc.Graph(id='top-graph'), md=8),Actividad 1: Correlaciones
Paso 5. Define un callback que tenga como inputs el valor de xaxis-dropdown y yaxis-dropdown y como output la figura de top-graph:
@app.callback(
Output('top-graph', 'figure'),
Input('xaxis-dropdown', 'value'),
Input('yaxis-dropdown', 'value'),
)
def update_callback(xaxis_col, yaxis_col):
fig = px.scatter(df, x=xaxis_col, y=yaxis_col)
return figActividad: Correlaciones
Ahora inténtalo con cualquier otro dataset de Plotly Express:
Actividad: Para recordar
-
Puedes utilizar archivos CSV como fuente de datos de tus tableros Dash utilizando Pandas.
-
Puedes utilizar Pandas para manipular el dataset dentro de un callback (e.g. filtrarlo u ordenarlo).
-
La biblioteca Dash Bootstrap Components permite la utilización de componentes de Bootstrap 4 en nuestras aplicaciones Dash.
Dash Sylvereye
-
Biblioteca Dash desarrollada en CentroGeo.
-
Permite la visualización de redes de caminos grandes utilizando WebGL.
-
Las visualizaciones son altamente personalizables.
-
Eventos de click para nodos y enlaces de la red.
Ejemplo 6: Visualización de una red de caminos
Ejemplo 6: Visualización de una red de caminos
import osmnx as ox
from dash import Dash
from dash_html_components import Div
from dash_sylvereye import SylvereyeRoadNetwork
from dash_sylvereye.utils import load_from_osmnx_graph
# configuración de la visualización
OSMNX_QUERY = 'Kamppi, Helsinki, Finland'
TILE_LAYER_URL = '//stamen-tiles-{s}.a.ssl.fastly.net/toner/{z}/{x}/{y}.png'
TILE_LAYER_SUBDOMAINS = 'abcd'
TILE_LAYER_ATTRIBUTION = 'Map tiles by <a href="http://stamen.com">Stamen Design</a>, under <a href="http://creativecommons.org/licenses/by/3.0">CC BY 3.0</a>. Data by <a href="http://openstreetmap.org">OpenStreetMap</a>, under <a href="http://www.openstreetmap.org/copyright">ODbL</a>.'
MAP_CENTER = [60.1663, 24.9313]
MAP_ZOOM = 15
MAP_STYLE = {'width': '100%', 'height': '98vh'}
# obtener la topología de la red desde OSM
road_network = ox.graph_from_place(OSMNX_QUERY, network_type='drive')
nodes_data, edges_data = load_from_osmnx_graph(road_network)
# construir visualización
app = Dash()
app.layout = Div([
SylvereyeRoadNetwork(
id='sylvereye-roadnet',
tile_layer_url=TILE_LAYER_URL,
tile_layer_subdomains=TILE_LAYER_SUBDOMAINS,
tile_layer_attribution=TILE_LAYER_ATTRIBUTION,
map_center=MAP_CENTER,
map_zoom=MAP_ZOOM,
map_style=MAP_STYLE,
nodes_data=nodes_data,
edges_data=edges_data
)
])
# correr visualización
if __name__ == '__main__':
app.run_server()Para recordar
-
Dash Sylvereye permite incrustar la visualización de una red de caminos en tu tablero Dash
-
La topología de una red de caminos puede ser obtenida desde OSM a través de la biblioteca OSMnx
-
Dash Sylvereye permite la configuración de la capa de mapa web sobre la que se dibuja la red de caminos
Ejemplo 7: Interacción con la red de caminos
Ejemplo 7: Interacción con la red de caminos
import osmnx as ox
from dash import Dash
from dash.dependencies import Input, Output
from dash_html_components import Div
from dash_html_components import H2, H3
from dash_sylvereye import SylvereyeRoadNetwork
from dash_sylvereye.utils import load_from_osmnx_graph
# configuración de la visualización
OSMNX_QUERY = 'Kamppi, Helsinki, Finland'
TILE_LAYER_URL = '//stamen-tiles-{s}.a.ssl.fastly.net/toner/{z}/{x}/{y}.png'
TILE_LAYER_SUBDOMAINS = 'abcd'
TILE_LAYER_ATTRIBUTION = 'Map tiles by <a href="http://stamen.com">Stamen Design</a>, under <a href="http://creativecommons.org/licenses/by/3.0">CC BY 3.0</a>. Data by <a href="http://openstreetmap.org">OpenStreetMap</a>, under <a href="http://www.openstreetmap.org/copyright">ODbL</a>.'
MAP_CENTER = [60.1663, 24.9313]
MAP_ZOOM = 15
MAP_STYLE = {'width': '100%', 'height': '84vh'}
# obtener la topología de la red desde OSM
road_network = ox.graph_from_place(OSMNX_QUERY, network_type='drive')
nodes_data, edges_data = load_from_osmnx_graph(road_network)
# construcción de la visualización
app = Dash()
app.layout = Div([
SylvereyeRoadNetwork(
id='sylvereye-roadnet',
tile_layer_url=TILE_LAYER_URL,
tile_layer_subdomains=TILE_LAYER_SUBDOMAINS,
tile_layer_attribution=TILE_LAYER_ATTRIBUTION,
map_center=MAP_CENTER,
map_zoom=MAP_ZOOM,
map_style=MAP_STYLE,
nodes_data=nodes_data,
edges_data=edges_data
),
H5("Clicked elements:"),
H6(id='h3-clicked-node-coords'),
H6(id='h3-clicked-edge-coords')
])
# callbacks
@app.callback(
Output('h3-clicked-node-coords', 'children'),
[Input('sylvereye-roadnet', 'clicked_node')])
def update_node_data(clicked_node):
if clicked_node:
return f'Clicked node coords: {clicked_node["data"]["lat"]}, \
{clicked_node["data"]["lon"]}'
@app.callback(
Output('h3-clicked-edge-coords', 'children'),
[Input('sylvereye-roadnet', 'clicked_edge')])
def update_edge_data(clicked_edge):
if clicked_edge:
return f'Clicked edge coords: {clicked_edge["data"]["coords"]}'
# correr visualización
if __name__ == '__main__':
app.run_server()Para recordar
-
Dash Sylvereye permite interactuar con los nodos (cruces de caminos) y los enlaces (caminos)
-
Lo anterior a través de la detección de eventos de click
-
Esto significa que puede asociar un callback al evento click de los nodos y/o enlaces
-
Dash Sylvereye pasará al callback los datos del elemento clickeado
Ejemplo 8: Personalización de la visualización de una red
Ejemplo 8: Personalización de la visualización de una red
import osmnx as ox
import numpy as np
from dash import Dash
from dash_html_components import Div
from dash_sylvereye import SylvereyeRoadNetwork
from dash_sylvereye.utils import load_from_osmnx_graph
from dash_sylvereye.enums import NodeSizeMethod, EdgeColorMethod, EdgeWidthMethod
from dash_sylvereye.defaults import get_default_node_options, get_default_edge_options
OSMNX_QUERY = 'Kamppi, Helsinki, Finland'
TILE_LAYER_URL = '//stamen-tiles-{s}.a.ssl.fastly.net/toner/{z}/{x}/{y}.png'
TILE_LAYER_SUBDOMAINS = 'abcd'
TILE_LAYER_ATTRIBUTION = 'Map tiles by <a href="http://stamen.com">Stamen Design</a>, under <a href="http://creativecommons.org/licenses/by/3.0">CC BY 3.0</a>. Data by <a href="http://openstreetmap.org">OpenStreetMap</a>, under <a href="http://www.openstreetmap.org/copyright">ODbL</a>.'
MAP_CENTER = [60.1663, 24.9313]
MAP_ZOOM = 15
MAP_STYLE = {'width': '100%', 'height': '84vh'}
# obtener la red desde OSM
road_network = ox.graph_from_place(OSMNX_QUERY, network_type='drive')
nodes_data, edges_data = load_from_osmnx_graph(road_network)
# asignar pesos aleatorios a los nodos y enlaces de acuerdo a una dist. libre de escala
for node in nodes_data: node["data"]["weight"] = 1 - np.random.power(a=3, size=None)
for edge in edges_data: edge["data"]["weight"] = 1 - np.random.power(a=3, size=None)
# configurar las opciones visuales de los nodos
node_options = get_default_node_options()
node_options["alpha_default"] = 0.25
node_options["size_method"] = NodeSizeMethod.SCALE
node_options["size_scale_field"] = "weight"
# configurar las opciones visualies de los enlaces
edge_options = get_default_edge_options()
edge_options["width_method"] = EdgeWidthMethod.SCALE
edge_options["width_scale_field"] = "weight"
edge_options["color_method"] = EdgeColorMethod.SCALE
edge_options["color_scale_field"] = "weight"
edge_options["color_scale_left"] = 0xcbdbff
edge_options["color_scale_right"] = 0x06696
# construir la visualización
app = Dash()
app.layout = Div([
SylvereyeRoadNetwork(
id='sylvereye-roadnet',
tile_layer_url=TILE_LAYER_URL,
tile_layer_subdomains=TILE_LAYER_SUBDOMAINS,
tile_layer_attribution=TILE_LAYER_ATTRIBUTION,
map_center=MAP_CENTER,
map_zoom=MAP_ZOOM,
map_style=MAP_STYLE,
nodes_data=nodes_data,
edges_data=edges_data,
node_options=node_options,
edge_options=edge_options
)
])
# correr servidor
if __name__ == '__main__':
app.run_server()Para recordar
-
Dash Sylvereye permite la configuración visual de los nodos y enlaces individuales de la red
-
Para los nodos es posible configurar su diámetro, color y transparencia
-
Para los enlaces es posible configurar su grosor, color y transparencia
-
Dash Sylvereye puede calcular automáticamente el color de nodos y enlaces en función de un atributo de peso
Ejemplo 9: Visualización de marcadores sobre la red
Ejemplo 9: Visualización de marcadores sobre la red
import osmnx as ox
from dash import Dash
from dash.dependencies import Input, Output
from dash_html_components import Div
from dash_html_components import H2, H3
from dash_sylvereye import SylvereyeRoadNetwork
from dash_sylvereye.utils import load_from_osmnx_graph, generate_markers_from_coords
from dash_sylvereye.defaults import get_default_marker_options
OSMNX_QUERY = 'Kamppi, Helsinki, Finland'
TILE_LAYER_URL = '//stamen-tiles-{s}.a.ssl.fastly.net/toner/{z}/{x}/{y}.png'
TILE_LAYER_SUBDOMAINS = 'abcd'
TILE_LAYER_ATTRIBUTION = 'Map tiles by <a href="http://stamen.com">Stamen Design</a>, under <a href="http://creativecommons.org/licenses/by/3.0">CC BY 3.0</a>. Data by <a href="http://openstreetmap.org">OpenStreetMap</a>, under <a href="http://www.openstreetmap.org/copyright">ODbL</a>.'
MAP_CENTER = [60.1663, 24.9313]
MAP_ZOOM = 15
MAP_STYLE = {'width': '100%', 'height': '80vh'}
# obtener red de caminos desde OSM
road_network = ox.graph_from_place(OSMNX_QUERY, network_type='drive')
nodes_data, edges_data = load_from_osmnx_graph(road_network)
# crear un marcador por cada nodo de la red
markers_coords = [ [node_data["lat"], node_data["lon"]] for node_data in nodes_data ]
markers_data = generate_markers_from_coords(markers_coords)
# escalar el tamaño de los marcadores al nivel de zoom
marker_options = get_default_marker_options()
marker_options["enable_zoom_scaling"] = True
# construir visualización
app = Dash()
app.layout = Div([
SylvereyeRoadNetwork(
id='sylvereye-roadnet',
tile_layer_url=TILE_LAYER_URL,
tile_layer_subdomains=TILE_LAYER_SUBDOMAINS,
tile_layer_attribution=TILE_LAYER_ATTRIBUTION,
map_center=MAP_CENTER,
map_zoom=MAP_ZOOM,
map_style=MAP_STYLE,
nodes_data=nodes_data,
edges_data=edges_data,
markers_data=markers_data,
marker_options=marker_options
),
H2("Clicked elements:"),
H3(id='h3-clicked-marker-coords')
])
@app.callback(
Output('h3-clicked-marker-coords', 'children'),
[Input('sylvereye-roadnet', 'clicked_marker')])
def update_marker_data(clicked_marker):
if clicked_marker:
marker = clicked_marker["marker"]
return f'Clicked marker coords: {[ marker["lat"], marker["lon"] ]}'
# correr visualización
if __name__ == '__main__':
app.run_server()Para recordar
-
Dash Sylvereye permite visualizar marcadores encima tanto del mapa web como de la red
-
Los marcadores son interactivos: es posible asociar un callback al evento click de cada marcador
-
Dash Sylvereye pasará los datos del marcador clickeado a un parámetro del callback
Actividad 2: Calles más largas
Paso 1. Haz una copia del siguiente notebook:
Actividad 2: Calles más largas
Actividad 2: Calles más largas
Paso 2. Asigna al campo "weight" de todos los enlaces la longitud de la calle:
for edge in edges_data:
edge["data"]["weight"] = edge["data"]["length"]
Paso 3. Indica a Dash Sylvereye que el ancho, color y transparencia (alpha) de los enlaces estarán escalados en proporción al campo "weight":
edge_options = get_default_edge_options()
edge_options["width_method"] = EdgeWidthMethod.SCALE
edge_options["width_scale_field"] = "weight"
edge_options["color_method"] = EdgeColorMethod.SCALE
edge_options["color_scale_field"] = "weight"
edge_options["color_scale_left"] = 0xcbdbff
edge_options["color_scale_right"] = 0x06696
edge_options["alpha_method"] = EdgeAlphaMethod.SCALE
edge_options["alpha_scale_field"] = "weight"Actividad 2: Calles más largas
Paso 4. Define un barra de navegación (navbar):
navbar = dbc.NavbarSimple(
brand="Visualization of street lengths with Dash Sylvereye",
brand_href="#",
color="primary",
dark=True,
)
Actividad 2: Calles más largas
Paso 5. Define un componente Dash Sylvereye que sólo reciba los datos de los enlaces y sus opciones de visualización:
sylvereye = \
SylvereyeRoadNetwork(
id='sylvereye-roadnet',
tile_layer_url=TILE_LAYER_URL,
tile_layer_subdomains=TILE_LAYER_SUBDOMAINS,
tile_layer_attribution=TILE_LAYER_ATTRIBUTION,
map_center=MAP_CENTER,
map_zoom=MAP_ZOOM,
map_style=MAP_STYLE,
edges_data=edges_data,
edge_options=edge_options,
tile_layer_opacity=TILE_LAYER_OPACITY
)Actividad 2: Calles más largas
Paso 6. Define un componente Markdown en donde se mostrará una tabla con los datos del enlace clickeado:
markdown = \
Markdown(id='markdown-street-data')
Actividad 2: Calles más largas
Paso 7. Pon todos los componentes juntos para conformar el layout de la visualización:
app.layout = dbc.Container(
[
navbar,
dbc.Row(
[
dbc.Col(sylvereye, md=10),
dbc.Col(markdown, md=2)
],
align='center'
)
], fluid=True
)Actividad 2: Calles más largas
Paso 8. Define un callback que devuelva una tabla Markdown con los datos del enlace clickeado:
@app.callback(
Output('markdown-street-data', 'children'),
[Input('sylvereye-roadnet', 'clicked_edge')])
def update_street_data(clicked_edge):
if clicked_edge:
data = clicked_edge["data"]["data"]
return f'''
## Query
{OSMNX_QUERY}
## Street data
| Property | Value |
| -------- | ----- |
| Source OSMID | {data["source_osmid"]} |
| Target OSMID | {data["target_osmid"]} |
| Street name| {data["name"]} |
| Max. speed | {data["maxspeed"]} |
| Length | {data["length"]} |
| One-way | {data["oneway"]} |
'''
Actividad 2: Calles más largas
Actividad 2: Calles más largas
Ahora inténtalo con con tu propia ciudad obteniendo las coordenadas centrales del sitio de OpenStreetMap:
Actividad 2: Calles más largas
Pasos para obtener las coordenadas centrales:
Actividad 2: Calles más largas
Actualiza las siguientes constantes en la libreta:
OSMNX_QUERY = 'poza rica de hidalgo, veracruz, mexico'
MAP_CENTER = [20.5377, -97.4405]
Finalmente, corre nuevamente todas las celdas, exceptuando las primeras celdas de instalación de bibliotecas.
Para recordar
-
Dash Sylvereye puede ser combinado con Dash Core components y Dash Bootstrap Components para crear tableros más atractivos
-
Dash Sylvereye puede establecer el estilo de los enlaces (grosor, color y transparencia) en función de los datos almacenados en los enlaces
-
Dash Sylvereye permite la personalización de la escala de colores
¡Gracias!
agarcia@centrogeo.edu.mx
Verano CentroGeo 2022
By Alberto Garcia-Robledo
