Utilisation du framework FW4SPL pour le web

Projet de fin d'étude ST50 - Printemps 2016

SCHWEITZER Olivier

Génie Informatique - I2RV

Tuteur en entreprise :

Moreau Johan

Suiveur UTBM :

Descamps Philippe

Sommaire

• Présentation de l'IRCAD
• Contexte
• Technologies et objectifs
• Réalisations
• Bilan

Présentation de l'IRCAD

• Institut de Recherche contre les Cancers de l'Appareil Digestif (Strasbourg)
• Fondé en 1994 par le Pr. Jacques Marescaux
• Centre de formation en chirurgie mini-invasive
• Centre de recherche :
  • Cancérologie digestive
  • Robotique médicale
  • Recherche Informatique

Contexte du projet

• Projet storage    gestion (serveur, BDD) + visualisation de données médicales             

• Données médicales : format DICOM  (Digital Imaging and COmmunications in Medicine) : image + metadonnées                                                       
• Besoin :  utiliser applications sur le web                                                       

Contexte du projet

• FW4SPL (Framework for Software Production Line) : permet de construire des logiciels pour le médical (C++)                                  

• FW4SPL basé sur différentes librairies externes (médicales, traitement images, visualisation, IHM...)
   
• FW4SPL = librairies externes + librairies FW4SPL                      

Outils & Technologies

• Emscripten
  • Création : Alon Zakai / Mozilla
  • Ensemble d'outils de compilation
  • C/C++       JavaScript optimisé
  • Permet de porter des applications C/C++ sur le web

Objectifs

• Compilation des librairies dépendantes

• Compilation de FW4SPL                         

• Tests et étude des performances         

Réalisations

Anonymisation DICOM

• Données médicales circulant sur internet : besoin d'anonymisation

• DICOM : fournit une spécification pour rendre données anonymes

• Utilisation de DCMTK compilé avec Emscripten                                  

• Application JavaScript                                                                              
  • Décide du traitement à effectuer
  • Appels à DCMTK (lecture & modifications fichiers DICOM)

Réalisations

Anonymisation DICOM

• Exemple :
  • Nom de patient : JOHN^SMITH    ANONYMIZED^ANONYMIZED

• Temps moyen pour 544 fichiers DICOM :  1min17s                
  • ~5x plus lent que version C++ (14,8s)           

• Application fonctionnelle pour preuve de concept                  

Réalisations

FW4SPL : les problématiques

• Plusieurs applications testées (traitements d'images, conversion de données)

• Librairies externes importantes pas compatibles avec Emscripten

• FW4SPL utilise beaucoup de librairies      grande quantité de code JavaScript et performances réduites

Bilan

• Projet et expérience très intéressants                                          

• Objectifs atteints en partie                                                              

• Performances assez faibles mais utilisation simplifiée              

• Avenir :                                                                                                
  • Traitements côté serveur en C++
  • Emscripten : nouveau format (émancipation JavaScript)

Prévisu dcm2pnm

DICOM

FW4SPL

Performances Emscripten

Anonymisation