Временные ряды для графов ДНК-ДНК взаимодействий

Саша Галицына

ШМТБ 2021

Теория эпигенетического кодирования

Структура хроматина как граф

Граф в развитии

С чем мы будем работать? 

Как решить такую задачу?

• Методы исследования графовой структуры
• Программирование на Python
• Браузеры для анализа биологических данных:
  например, HiGlass

Немного про нас

• Саша Галицына: аспирант Сколтеха, ведет проекты на ШМТБ с 2015
• Коля Быков: разработчик программы для анализа кластеров в графах ДНК-ДНК взаимодействий HiChew: https://github.com/encent/hichew

ШМТБ 2018